Research Projects

Philosophy

We generate and use genomic data and bioinformatic methods to study health, disease and evolutionary forces involved. Our focus is on using computational approaches and massive datasets to help inform clinical decisions and precision medicine.

The emerging area of Evolutionary Medicine.


We have research activities in the following areas:

 dna-pill-6824-2560x1600

Pharmacogenomics

We are interested in characterizing the patterns of genetic diversity within drug metabolizing enzymes (DME), to understand the genetic basis underlying variable drug and metabolic response. At the Pharmacogenomic Centre Beaulieu-Saucier located at the MHI, we are in a unique position to accurately type large clinical cohorts and interrogate DME variation from genomic and transcriptomic datasets.

Read more

La pharmacogénomique est l’étude de l’impact du profil génétique d’un individu sur sa réponse aux médicaments, et a mener à la découverte de centaine de gènes de métabolisme.  De par leur diversité génotypique et phénotypique, les “pharmacogènes” constituent un système modèle de choix pour étudier les pressions de sélection naturelle, la pléiotropie et les intéractions. 

En savoir plus


  

 

circos-genome-biology-mirna
Featured image created by Martin Krzywinski

 

Deep learning for personal genomics

Recent advances in genomic technologies resulted in an explosion of data, propelling human genomics into the Big Data era and its challenges. In collaboration with the Montreal Institute for Learning Algorithm, we develop and use deep learning techniques to extract important information from large-scale biomedical data, in the context of precision medicine.

Read more

Les progrès récents en génomique et domaines connexes exigent une grande puissance de calcul et des algorithmes intelligents afin d’analyser les données massives générées. Nous développons et appliquons, en collaboration avec le MILA situé au Département d’Informatique et de recherche opérationnelle de l’Université de Montréal,  des approches d’intelligence artificielles visant à améliorer la médecine de précision.

En savoir plus


  

shutterstock_1286234301

Cardiovascular and reproductive genomics

We use genomic and clinical data to study the causes of reproductive challenges in human, and their links with cardiovascular traits. We aim at identifying key biological players interacting at all stages in the reproduction process. Our main focus is to mine genomes of individuals in populations with detailed fertility and cardiovascular phenotypes and rich environmental metrics. We partner with reproductive clinics through the MHICC to accomplish this goal.

Read more

Nous utilisons des données génomiques et cliniques pour étudier les causes des problèmes reproductifs, et leur implication dans l’étiologie des maladies cardiovasculaires. Ce volet de recherche est d’importance pour identifier les facteurs clés interagissant avec la santé métabolique des individus à différentes étapes du cycle reproducteur humain. Nous harmonisons différents jeux de données OMICS en biologie reproductive, et formons une cohorte québecoise en partenariat avec le Centre de Coordination des Essais Cliniques de Montréal. 

En savoir plus


  
platypusr_468x318

Mammalian evolution

The duck-billed Platypus has puzzled scientists ever since its discovery 200 years ago.

Read more: http://www.dailymail.co.uk/news/article-564748/Its-bird-beaver—actually-duck-billed-platypus-scientists-decode-DNA-time.html#ixzz4Ug3bGfqX

Genomics of Horse cloning